手术治疗腰椎间盘突出和腰椎管狭窄症，虽然多数可以收立竿见影之效，但远期效果难尽人意,手术后易出现的常见并发症有:
(1) 感染。术后可见手术切口感染还可能发生椎间隙感染。主要表现是：原有的神经痛和腰腿痛症状消失，5～14天后发生剧烈的腰痛伴臀部或下腹部抽痛和肌肉痉挛，不能翻身，痛苦很大。
(2) 神经损伤。手术中在硬膜外或硬膜内都有可能损伤神经根。
(3) 大血管损伤。最常见的是经后路手术时损伤腹后壁大的血管损伤。
(4) 粘连与瘢痕。手术部位的神经根与椎板切除后硬脊膜的暴露部分常发生粘连与瘢痕，会留有腰痛或神经根放射痛。椎管后壁骨缺损处瘢痕组织增生、粘连导致术后再狭窄;血肿机化、粘连及钙化，往往导致神经根管再度狭窄。
(5) 脊柱不稳。部分病人手术以后腿痛消失而腰痛持续存在 。
(6) 脏器损伤。血管损伤时可能伴有其他脏器损伤，如膀胱、输尿管或小肠等。
(7) 脑脊液瘘或脊膜假性囊肿: 脑脊液瘘多在术后第3～4天时发生;硬脊膜假性囊肿多在术后几个月内出现腰腿痛，在手术疤痕处或腰骶部有球形囊样物与硬膜粘连。压迫囊样肿物，可引起坐骨神经痛。